重要性不明的BRCA2变体通过功能数据添加重新分类

一项新的研究发现,功能数据的添加可以帮助重新分类BRCA2 DNA结合域内重要性不明的种系变体。

 

BRCA2中的致病性种系变异会增加人患多种癌症(尤其是乳腺癌和卵巢癌)的风险。对这种病原体或可能的病原体种系变异的了解可以影响该人筛查癌症的方式,并在该人患上癌症时通知任何以后的治疗方法,例如PARP抑制剂治疗。

 

但是根据Mayo ClinicFergus CouchNIH ClinVar数据库中列出的BRCA2中有超过4,500 VUS,约占那里列出的BRCA2变体的一半。他在一封电子邮件中写道:“这意味着世界上成千上万的受测个体具有这些变异体,但不了解其临床意义,因此无法使用它们来选择临床管理方法。”

 

Couch和他的同事使用同源性指导的DNA修复测定法来评估影响BRCA2 DNA结合域的约250 VUS是否起作用。通过将这些发现与他们的合作者在Ambry Genetics上进行的变体分类相结合,他们可以将大多数VUS重新分类为可能的病原体或病原体或可能的良性或良性,如上周五在《美国人类遗传学杂志》上报道的那样。

 

研究人员从ClinVar中选择了252个影响BRCA2 DNA结合结构域的VUS进行功能分析。Couch指出,该域是大多数致病性错义BRCA2突变所在的位置。通过HDR分析,他们发现VUS中的90个无效,而162个正常。

 

研究人员说,HDR测定被认为是金标准测定,他们还指出,在基于分子病理学的美国医学遗传学和基因组学/协会基于变体分类方案的证据中,HDR被作为强有力的证据。通过HDR分析和先前通过定量分类模型分析的49个变异体中,研究人员报告了48个具有一致的结果。

 

同时,Ambry Genetics已观察到这252个变体中的186个,将其中154个分类为VUS。通过折叠HDR分析蛋白的功能数据,研究人员将最初确定为VUS86%变体重新分类。特别是,将132个重新分类为可能是致病的或致病的,将93个重新分类为可能是良性的或良性的。仅有22个变体仍被归类为VUS,并且这些变体的数据有限或冲突。

 

研究人员补充说,这些VUS的重新分类影响了在Ambry进行测试的1,900个人的结果。Couch说,这种分类上的转变可能会改变对个体进行癌症监测或治疗的方式。他补充说,如果某人现在具有被认为可能是致病性或致病性的变体,则该人可能会寻求更多的乳房X线照片检查方法,甚至进行预防性乳房切除术或卵巢切除术。对于癌症患者,他指出,卵巢癌或转移性乳腺癌患者现在有资格接受PARP抑制剂的靶向治疗。

 

Couch说,这些发现进一步表明,其他VUS可以类似地通过HDR和其他检测方法进行重新评估。他和他的同事正在朝着这个目标努力,以收集有关该区域所有可能变异体的信息,并进一步调查变异体是否影响对PARP抑制剂等疗法的反应。

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